تواجه الإدارة الإلكترونية عدة تحديات، منها:
1. الأمان والخصوصية: حماية البيانات والمعلومات الحساسة من الاختراقات والهجمات الإلكترونية.
2. البنية التحتية: الحاجة إلى وجود بنية تحتية تكنولوجية متطورة لدعم الأنظمة الإلكترونية.
3. التدريب والتأهيل: ضرورة تدريب الموظفين على استخدام الأنظمة الجديدة والتكنولوجيا الحديثة.
4. التغيير الثقافي: مقاومة التغيير من قبل بعض الموظفين والمواطنين، مما قد يؤثر على تنفيذ الإدارة الإلكترونية.
5. التكامل بين الأنظمة: صعوبة دمج الأنظمة المختلفة مع بعضها البعض لتحقيق تواصل فعال